2'-O-เมทิล-rA(N-Bz)ฟอสโฟรามิไดต์

2′-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramidite เป็นโมโนเมอร์ฟอสโฟรามิไดต์ที่ได้รับการดัดแปลงซึ่งสามารถนำไปใช้ในการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ได้ การดัดแปลง 2′-O-methyl ให้ความต้านทานต่อนิวคลีเอสต่อโอลิโกนิวคลีโอไทด์ได้อย่างมาก ในขณะที่ยังคงรักษาคุณสมบัติพันธะไฮโดรเจนของดูเพล็กซ์ RNA/RNA อย่างซื่อสัตย์มากกว่าลูกผสม DNA/RNA ในการใช้งานการรบกวน RNA (RNAi) 2′-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramidite มักถูกรวมเข้ากับความรู้สึกและสายแอนติเซนส์ของดูเพล็กซ์ RNA (siRNA) ขนาดเล็กที่รบกวน เพื่อเพิ่มเสถียรภาพของซีรั่มและลดผลกระทบนอกเป้าหมายโดยไม่กระทบต่อกิจกรรมของ RNAi 2′-O-Methyl-rA(N-Bz) ฟอสโฟรามิไดต์ยังทำหน้าที่เป็นตัวสร้างที่สำคัญในการสังเคราะห์ทางเคมีของ RNA โอลิโกนิวคลีโอไทด์ที่มีการดัดแปลง 2′-O-methyladenosine เฉพาะไซต์; กลุ่มป้องกัน (DMT ที่ 5 ′, Bz ที่ N6, CE phosphoramidite ที่ 3 ′) อนุญาตให้ประกอบสาย RNA แบบขั้นตอนที่มีความเที่ยงตรงสูงและควบคุมเครื่องสังเคราะห์ DNA / RNA อัตโนมัติ นอกเหนือจากการบำบัดด้วย RNA แล้ว 2′-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramidite ยังพบการประยุกต์ใช้ในการสังเคราะห์แบบจำลอง RNA ที่มีสาขาฟอสเฟต เพื่อศึกษาสถาปัตยกรรม RNA ที่ผิดปกติ และในการเตรียมโพรบโอลิโกนิวคลีโอไทด์เรืองแสงที่มีความเสถียรทางความร้อน

พารามิเตอร์ผลิตภัณฑ์

ทำไมต้องคอสเพอร์ฟาร์ม? – ข้อได้เปรียบทางการแข่งขันของเรา

ข้อดีของผลิตภัณฑ์

1. การดัดแปลง 2′-O-Methyl เพื่อการต้านทานนิวคลีเอสและความคงตัวทางความร้อน

การดัดแปลง 2′-O-methyl ที่ตำแหน่งไรโบส 2′ เป็นหนึ่งในการดัดแปลงทางเคมีที่ได้รับการตรวจสอบอย่างกว้างขวางมากที่สุดในการบำบัดด้วยโอลิโกนิวคลีโอไทด์ Oligonucleotides ที่รวมเอา 2′-O-Methyl-rA (N-Bz) Phosphoramidite แสดงให้เห็นความต้านทานที่เพิ่มขึ้นอย่างเห็นได้ชัดต่อ endo- และ exonucleases เมื่อเปรียบเทียบกับ RNA ที่ไม่มีการดัดแปลง พร้อมความเสถียรทางความร้อนที่ดีขึ้นของ RNA / RNA duplexes (เพิ่ม Tm) โดยไม่กระทบต่อความจำเพาะในการจับคู่ฐานของ Watson – Crick การปรับเปลี่ยนนี้ประสบความสำเร็จในการนำไปใช้ในยาโอลิโกนิวคลีโอไทด์ที่ได้รับการอนุมัติจาก FDA และผู้ที่อยู่ในขั้นทางคลินิกจำนวนมาก

2. การป้องกัน N6-Benzoyl สำหรับการสังเคราะห์ความเที่ยงตรงสูง

หมู่ปกป้องเบนโซอิล (Bz) บนเอมีน N6 เอ็กโซไซคลิกของเบสอะดีนีนป้องกันปฏิกิริยาข้างเคียงที่ไม่พึงประสงค์ในระหว่างรอบการเชื่อมต่อฟอสฟอรามิไดต์ เช่น เหตุการณ์การแตกแขนงหรือการสิ้นสุดสายโซ่ที่เกิดจากการขับบริสุทธิ์หรือเอซิเลชัน หมู่ Bz จะถูกกำจัดออกอย่างหมดจดภายใต้เงื่อนไขการกำจัดโอลิโกนิวคลีโอไทด์มาตรฐาน (แอมโมเนียเข้มข้น 55°C 8–16 ชั่วโมง หรือ AMA) ทำให้ได้เบสอะดีนีนตามธรรมชาติโดยไม่มีผลพลอยได้ที่ตรวจพบได้

3. C3′-Endo Sugar Conformation ก่อนการจัดองค์กร

การทดแทน 2′-O-methyl จะล็อคน้ำตาลไรโบสให้อยู่ในโครงสร้าง C3′-endo (ทิศเหนือ) ซึ่งเป็นโครงสร้างเดียวกับที่ RNA นำมาใช้ในรูปแบบดูเพล็กซ์แบบ A การจัดโครงสร้างล่วงหน้าตามโครงสร้างนี้จะช่วยลดการลงโทษเอนโทรปิกเมื่อไฮบริไดเซชันไปยังเป้าหมาย RNA เสริม ส่งผลให้สัมพรรคภาพการจับสูงขึ้น (Tm สูงกว่า) สำหรับโอลิโกนิวคลีโอไทด์ที่ดัดแปลง 2′-O‑เมทิลที่สัมพันธ์กับ DNA หรือ RNA ที่ไม่ได้ดัดแปลงของลำดับเดียวกัน

4. ความเข้ากันได้ของกลุ่มการปกป้องมาตรฐานสำหรับการสังเคราะห์อัตโนมัติ

2′-O-Methyl-rA(N-Bz) ฟอสโฟรามิไดต์มีกลุ่มป้องกัน 5′-O-DMT และ N6-Bz แบบเดียวกันที่ใช้ใน RNA ฟอสโฟรามิไดต์มาตรฐาน พร้อมด้วยฟอสโฟรามิไดต์ β-ไซยาโนเอทิล (CE) ที่ตำแหน่ง 3′ การออกแบบนี้ช่วยให้มั่นใจได้ถึงการบูรณาการอย่างราบรื่นในเวิร์กโฟลว์ซินธิไซเซอร์ DNA/RNA อัตโนมัติที่มีอยู่ โดยไม่ต้องใช้โปรโตคอลการปลดการป้องกันแบบพิเศษหรือเงื่อนไขการเชื่อมต่อที่แก้ไข

5. ประโยชน์ในการรักษาในวงกว้างข้ามแพลตฟอร์มโอลิโกนิวคลีโอไทด์

2′-O-Methyl-rA(N-Bz) ฟอสโฟรามิไดต์ถูกใช้ในหลายแพลตฟอร์มการรักษาโอลิโกนิวคลีโอไทด์: siRNA (การปรับเปลี่ยนสายการรับรู้และแอนตี้เซนส์), โอลิโกนิวคลีโอไทด์แอนติเซนส์ (ASO) สำหรับการระงับเสียงของยีน, แอปทาเมอร์สำหรับการจัดส่งแบบกำหนดเป้าหมายและแอปพลิเคชันการวินิจฉัย และโพรบ RNA ที่ดัดแปลงสำหรับการวินิจฉัยระดับโมเลกุล การดัดแปลง 2′-O-methyl ยังใช้อย่างกว้างขวางใน CRISPR‑Cas guide RNA เพื่อเพิ่มเสถียรภาพและประสิทธิภาพการแก้ไข

สถานการณ์การใช้งาน

1. การพัฒนาการรักษา siRNA

2′-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramidite ใช้เพื่อแนะนำการดัดแปลง 2′-O-methyladenosine ในความรู้สึกและ/หรือสาย antisense ของดูเพล็กซ์ RNA (siRNA) ขนาดเล็กที่รบกวน เพื่อเพิ่มความเสถียรของซีรั่ม ลดผลกระทบนอกเป้าหมายที่อาศัยกลไก RNAi (เช่น การโหลดสายผู้โดยสาร) และลดการกระตุ้นภูมิคุ้มกัน (การเปิดใช้งาน TLR7/8) การดัดแปลง 2′-O-methyl เป็นองค์ประกอบมาตรฐานของแพลตฟอร์ม siRNA ขั้นสูงทางการแพทย์จำนวนมาก

2. การผลิต Antisense Oligonucleotide (ASO)

2′-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramidite ถูกรวมเข้ากับ antisense oligonucleotides อย่างกว้างขวางสำหรับการใช้งานในการทำให้ยีนเงียบลง การดัดแปลง 2′-O-methyl ให้ความต้านทานต่อนิวคลีเอสต่อ ASOs ในของเหลวทางชีวภาพและช่วยเพิ่มความสัมพันธ์ผูกพันกับเป้าหมาย RNA เสริมโดยไม่รบกวนกลไกความแตกแยกที่ใช้สื่อกลาง RNase H (เมื่ออยู่ในตำแหน่งในการออกแบบ 2′-O ‑ methyl / 2′-deoxy gapmer)

3. การสังเคราะห์ทางเคมีของ RNA Oligonucleotide

2′-O-Methyl-rA(N-Bz) ฟอสโฟรามิไดต์ทำหน้าที่เป็นตัวสร้างสำหรับการสังเคราะห์ทางเคมีในเฟสของแข็งของ RNA โอลิโกนิวคลีโอไทด์ที่มีสารตกค้าง 2′-O-เมทิลอะดีโนซีนเฉพาะไซต์ กลุ่มการป้องกัน (5′-O‑DMT, N6‑Bz, CE ฟอสโฟรามิไดต์) เข้ากันได้กับวงจรการสังเคราะห์ RNA มาตรฐานและเงื่อนไขการยกเลิกการป้องกัน (NH₃, 55°C, 8–16 ชั่วโมง หรือ AMA) ช่วยให้สามารถบูรณาการเข้ากับขั้นตอนการทำงานการสังเคราะห์ที่กำหนดไว้ได้อย่างราบรื่น

4. การออกแบบโพรบโอลิโกนิวคลีโอไทด์เรืองแสง

การดัดแปลง 2′-O-methyl ปรับปรุงความเสถียรทางความร้อนของโพรบฟลูออเรสเซนต์ (เช่น บีคอนโมเลกุล โพรบ TaqMan) ที่ใช้ใน PCR แบบเรียลไทม์และไฮบริดในแหล่งกำเนิด 2′-O-Methyl-rA(N-Bz) ฟอสโฟรามิไดต์ช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนลำดับของโพรบได้อย่างมีเสถียรภาพ เพิ่มอัตราส่วนสัญญาณต่อเสียงรบกวน และทำให้การตรวจจับเป้าหมาย RNA ที่มีความอุดมสมบูรณ์ต่ำมีประสิทธิภาพมากขึ้น

5. การพัฒนา Aptamer แอพทาเมอร์ดัดแปลงทางเคมีที่ผสมผสานกัน

นิวคลีโอไทด์ 2′-O-methyl แสดงความต้านทานนิวคลีเอสที่ดีขึ้น ขยายครึ่งชีวิต ในสิ่งมีชีวิต และเพิ่มความสัมพันธ์ในการจับเป้าหมายเมื่อเปรียบเทียบกับแอปทาเมอร์ RNA ที่ไม่มีการดัดแปลง 2′-O-Methyl-rA(N-Bz) ฟอสโฟรามิไดต์เป็นองค์ประกอบหลักสำหรับการสร้างไลบรารีแอปทาเมอร์ที่ดัดแปลงด้วย 2′-O-methyl ผ่านการสังเคราะห์เฟสของแข็ง

6. การปรับเปลี่ยน CRISPR‑Cas Guide RNA (gRNA)

การดัดแปลง 2′-O-methyl ที่ตำแหน่งเฉพาะใน CRISPR‑Cas gRNA สามารถเพิ่มความคงตัว ลดภูมิคุ้มกัน และปรับปรุงประสิทธิภาพการแก้ไขในเซลล์และในร่างกาย 2′-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramidite ช่วยให้การแนะนำสารตกค้าง 2′-O-methyladenosine เฉพาะไซต์เข้าไปใน gRNA ที่สังเคราะห์ทางเคมีได้

7. การวิจัย RNA แบบแยกสาขาฟอสเฟต

นักวิจัยที่ศึกษาสถาปัตยกรรม RNA ที่ผิดปกติ เช่น RNA ที่มีกิ่งฟอสเฟต ใช้ 2′-O-Methyl-rA(N-Bz) ฟอสโฟรามิไดต์ เพื่อเตรียมโอลิโกนิวคลีโอไทด์แบบจำลองที่มีกลุ่ม 2′-OH อิสระเพียงกลุ่มเดียว เพื่อตรวจสอบความเสถียรทางไฮโดรไลติกของการเชื่อมโยงฟอสโฟไตรเอสเตอร์แบบกิ่งก้านภายใต้สภาวะทางสรีรวิทยา

8. การศึกษาความคงตัวทางความร้อนของโอลิโกนิวคลีโอไทด์ดัดแปลง

2′-O-Methyl-rA(N-Bz) ฟอสโฟรามิไดต์ใช้ในการศึกษาอย่างเป็นระบบเกี่ยวกับเสถียรภาพทางความร้อน (Tm) ของดูเพล็กซ์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ที่ดัดแปลง รวมถึงการจำแนกลักษณะของผลกระทบเชิงตำแหน่งของการปรับเปลี่ยน 2′-O-เมทิลต่ออุณหภูมิการหลอมละลายของดูเพล็กซ์และอุณหพลศาสตร์ของไฮบริไดเซชัน

9. การสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์แบบโซลิดเฟส

นักเคมีในกระบวนการพัฒนากระบวนการและผู้เชี่ยวชาญด้านการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ใช้ 2′-O-Methyl-rA(N-Bz) ฟอสโฟรามิไดต์ เพื่อปรับสภาวะการเชื่อมต่อ เกณฑ์วิธีในการยกเลิกการป้องกัน และวิธีการทำให้บริสุทธิ์สำหรับการผลิตขนาดใหญ่ของการบำบัดกรดนิวคลีอิกดัดแปลง 2′-O-เมทิล Cosperpharm ให้ข้อมูลการวิเคราะห์เฉพาะแบทช์เพื่อสนับสนุนการตรวจสอบกระบวนการและกิจกรรมการขยายขนาด

10. การพัฒนาวิธีวิเคราะห์เพื่อควบคุมคุณภาพโอลิโกนิวคลีโอไทด์

2′-O-Methyl-rA(N-Bz) ฟอสโฟรามิไดต์ถูกใช้เป็นมาตรฐานอ้างอิงในการพัฒนาวิธี HPLC และ LC‑MS สำหรับการหาปริมาณปริมาณนิวคลีโอไซด์ที่ถูกดัดแปลงในสารตัวยาและผลิตภัณฑ์ยาที่เป็นโอลิโกนิวคลีโอไทด์ เช่นเดียวกับการระบุสิ่งเจือปนที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ (เช่น การกำจัด DMT ที่ไม่สมบูรณ์ ผลิตภัณฑ์กำจัดบริสุทธิ์ ผลพลอยได้จากการเกิดออกซิเดชันของฟอสไฟต์)

ติดต่อเรา

ต้องการฟอสโฟรามิไดต์ 2′-O-Methyl-rA(N-Bz) ที่เชื่อถือได้และมีความบริสุทธิ์สูงสำหรับโครงการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ครั้งต่อไปของคุณหรือไม่ ทีมงานของ Cosperpharm พร้อมที่จะช่วยเหลือเกี่ยวกับข้อมูลจำเพาะของผลิตภัณฑ์ ความต้องการด้านเอกสาร และโซลูชันด้านซัพพลายเชนที่ปรับให้เหมาะกับการใช้งานของคุณ